实验教学中心接受校、院二级管理，推行教学委员会统一领导下的中心主任负责制，医学院教学指导委员会审定实验课程的设置。中心主任由教学经验丰富、科研能力强、教学和科研成绩突出的专家担任，负责实验室建设规划的制定；副主任由具有博士学位的中青年教学骨干担任，主持实验中心日常工作。各实验室设主任和副主任，主任由活跃在教学科研第一线、教学理念先进的教授担任，各相关学科分管教学的负责人担任实验室副主任。